Університет було засновано у 1930 році під назвою Одеський інститут інженерів водного транспорту. На цей час до складу університету входить 3 навчально-наукових інститута та 3 факультета: інститут морського флоту, інститут морського бізнесу, морський гуманітарний інститут, факультет портового інжинірингу, факультет воднотранспортних і шельфових споруд, факультет суднобудування, інформаційних технологій і системотехніки. В Одеському національному морському університеті готують фахівців для морського флоту та берегової інфраструктури морського і річкового транспорту України та закордонних країн за 15 спеціальностями: будівництво та цивільна інженерія; гідротехнічне будівництво, водна інженерія та водні технології; галузеве машинобудування; суднобудування; річковий та морський транспорт; електроенергетика, електротехніка та електромеханіка; транспортні технології (на морському та річковому транспорті); комп'ютерні науки; право; економіка; підприємництво, торгівля та біржова діяльність; менеджмент; туризм; психологія; філологія.